Começaram o ano de 1954 com 148 alunos matriculados distribuídos para o Jardim de Infância à 4ª série do Primário (hoje Ensino Fundamental).
A primeira sede da Escola Santo Tomás de Aquino foi na rua Guajajaras, 149, no centro de Belo Horizonte.
No dia 7 de março de 1954, foi celebrada por Dom Cabral uma missa e a bênção da casa que seria a primeira sede da escola Santo Tomás de Aquino.
Em 1957, a logomarca da ESTA foi criada pelas monjas beneditinas que bordaram a da ESTA. Santo Tomás é considerado o Anjo das Escolas e carrega nas mãos uma estrela simbolizando sua sabedoria.
Já em 1958 a ESTA se mudou para as novas instalações na Rua Timbiras, 1778.
Em 1960, aconteceu a primeira saída a campo da 3ª série para Ouro Preto.
Demonstrando relevância entre o conhecimento teórico e prático, dinâmica pedagógica da escola, em 1962, a ESTA promoveu uma visita à hidrelétrica de Três Marias, ainda em construção.
Também em 1962, Dom Marcos escreveu o Hino da ESTA, sendo musicado pela professora Carmem Silvia Vasconcelos. Foi cantado pela primeira vez na Primeira Comunhão dos alunos do mesmo ano.
As fundadoras D. Tereza e D. Maria Sylvia levantaram recursos para adquirir o imóvel da rua Timbiras em 1963. A antiga casa foi reformada e ganhou uma arquitetura moderna mantendo o compromisso com a qualidade e com o bem-estar da comunidade escolar
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